本发明公开了一种番茄果实干汁性状的特异性序列,该序列如SEQ ID NO:1所示,还提供了鉴定上述性状的方法与分子标记物,包括如SEQ ID NO:2所示的上游引物,如SEQ ID NO:3所示的下游引物,也提供了鉴定上述性状的方法:(1)以待鉴定番茄的基因组DNA为模板,用所述分子标记物进行PCR扩增;(2)对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,如果待鉴定番茄的PCR扩增产物含有如SEQ ID NO:1所示的DNA片段,则即可鉴定出该待鉴定番茄为有汁番茄,反之则为干汁番茄。利用本发明进行番茄果实干汁性状的分子标记辅助选择,可提高选择效率,加快育种进程;本发明只需通过简单的DNA提取、PCR特异性扩增、琼脂糖凝胶电泳检测即可完成对样品的鉴别。