Described herein are methods of identifying immunoprotective neoepitopes from cancer tissue DNA of cancer patients using biophysical principles and bioinformatics techniques. The identification of immunoprotective neo-epitopes provides a pharmaceutical composition with a limited number of tumor-specific peptides suitable for individualized genomics-driven immunotherapy of human cancers. Specifically, a method to use the conformational stability of the epitope in the MHC protein-binding groove to predict the immunogenicity of the peptide in a putative neo peptide set derived from a tumor from a cancer patient is disclosed herein . Pharmaceutical compositions and methods of administration are also included.生物物理学的原理ならびにバイオインフォマティクス技術を使用して、癌患者の癌組織ＤＮＡから免疫防御ネオエピトープを同定する方法が本明細書で記載される。免疫防御ネオエピトープの同定は、ヒト癌の個別化されたゲノミクス駆動型免疫療法に好適な限られた数の腫瘍特異的ペプチドを有する医薬組成物を提供する。特定的には、癌患者からの腫瘍由来の推定ネオペプチドセットにおけるペプチドの免疫原性を予測するために、ＭＨＣタンパク質－結合溝におけるエピトープの立体構造安定性を使用する方法が本明細書で開示される。医薬組成物および投与方法もまた含まれる。
