本发明属于基因工程领域,具体涉及一种烟草GCN2启动子,其核苷酸序列为:(1)SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列;或(2)与(1)限定的核苷酸序列中至少具有90%同源性的核苷酸序列。本发明还涉及烟草GCN2启动子在启动目的基因表达中的应用,以及应用方法。可以驱动GUS基因的表达,可以作为烟草生物反应器外源基因所用的表达元件;同时该序列位于烟草GCN2的上游,在烟草中可以启动GCN2基因的表达,其序列中存在的植物激素等响应元件可以用来调控GCN2基因的表达,进而调控烟草的蛋白合成;本发明有助于促进人们对烟草响应胁迫的研究,在农业领域具有广阔的应用空间和市场前景。