A light source device (3) that supplies illumination light, an imaging optical system (11) that forms an optical image of a subject with a variable focus position, and an imaging unit (12) that captures the optical image and outputs the image. A brightness detection unit (23) for detecting the brightness of the image, an auxiliary AF unit (27) for estimating the temporary in-focus position based on the brightness of the image detected by the brightness detection unit (23), An imaging system comprising: a control unit (24) that sets a range that is narrower than the entire scan range, including a temporary in-focus position, and a contrast AF unit (26) that performs contrast AF within the scan range.照明光を供給する光源装置(3)と、フォーカス位置可変に被検体の光学像を結像する結像光学系(11)と、光学像を撮像して画像を出力する撮像部(12)と、画像の明るさを検出する明るさ検出部(23)と、明るさ検出部(23)により検出される画像の明るさに基づいて仮合焦位置を推定する補助AF部(27)と、仮合焦位置を含み全スキャン範囲よりも狭い範囲をスキャン範囲として設定する制御部(24)と、スキャン範囲内でコントラストAFを行うコントラストAF部(26)と、を備える撮像システム。