本发明公开了一个磷酸甘露糖异构酶基因及其编码蛋白与应用。其目的是提供一种磷酸甘露糖异构酶基因及其编码蛋白与其在筛选转基因植物中的应用。该基因是下述核苷酸序列之一：1)序列表中SEQ ID №：1的DNA序列；2)编码序列表中SEQ ID №：2的DNA序列；3)在高严谨条件下可与序列表中SEQ ID №：1限定的DNA序列杂交的核苷酸序列。甘露糖对人畜无危害，在环境中易降解，且该选择标记系统具有产物安全、选择剂价格低廉、选择程序简单，而且不影响转化植物的代谢平衡，转基因植株生长旺盛，筛选效果显著等优点，在转基因植物研究及市场化过程中具有潜在的、广泛的应用前景，有望发展成为植物转化中主导选择标记系统。
