本发明提供了一种植物来源的磷酸甘露糖异构酶基因OsPMI2,该磷酸甘露糖异构酶基因OsPMI2分离、克隆自水稻。本发明的磷酸甘露糖异构酶基因OsPMI2的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。本发明还提供一种含有OsPMI2的原核表达载体。本发明还提供一种磷酸甘露糖异构酶的酶活分析方法。并且本发明提供一种含有OsPMI2的表达盒和一种植物表达载体,以及该表达盒和表达载体在植物遗传转化方面的应用。本发明利用OsPMI2基因构建的植物表达载体,以甘露糖为筛选剂,成功实现了转化水稻细胞。本发明成功分离和克隆出植物来源的磷酸甘露糖异构酶基因,由于该磷酸甘露糖异构酶基因来源于植物(水稻),对人类没有潜在危险。可以用于替代来自大肠杆菌的磷酸甘露糖异构酶,从而降低潜在的安全风险。