By removing impurities from a sample containing the PEG protein, PEG proteins, particularly, but not exclusively, process for purifying vitamin K-dependent blood coagulation factor IX, factor such as (FIX), the present invention, the method and therapeutic proteins, are purified by, in particular, but not exclusively, relates to the treatment of a disease that is alleviated, such as prophylactic treatment of hemophilia, the blood coagulation factor, to the use of the purified protein.本発明は、PEG化タンパク質を含むサンプルから不純物を除去することによる、PEG化タンパク質、特に、それだけではないが、第IX因子(FIX)などのビタミンK依存性血液凝固因子の精製方法、前記方法により精製されるタンパク質、及び治療における、特に、それだけではないが、血友病の予防的治療などの、血液凝固因子によって緩和される疾病の治療に関する、前記精製タンパク質の使用に関する。