Herein is reported a polypeptide-polynucleotide-complex as therapeutic agent and its use as tool for the targeted delivery of an effector moiety. The polynucleotide part of the complex is essentially resistant to proteolytic and enzymatic degradation in vivo. Additionally the polypeptide part specifically binds to a compound or structure such as a tissue or organ, a process or a disease. Thus, one aspect as reported herein is a polypeptide-polynucleotide-complex comprising a) a polypeptide specifically binding to a target and conjugated to a first member of a binding pair, b) a polynucleotide linker conjugated at its first terminus to the second member of the binding pair, and c) an effector moiety conjugated to a polynucleotide that is complementary to at least a part of the polynucleotide linker.本明細書においては、治療剤としてのポリペプチド-ポリヌクレオチド複合体を報告し、かつエフェクター成分の標的化された送達のためのツールとしてのその使用を報告する。複合体のポリヌクレオチド部分は、インビボでのタンパク質分解および酵素分解に対して本質的に耐性である。さらに、ポリペプチド部分は、化合物または組織もしくは器官などの構造に、つまりプロセスまたは疾患に応じて、特異的に結合する。したがって、本明細書において報告される1つの局面は、a) 標的に特異的に結合する、および結合対の第1のメンバーとコンジュゲートしているポリペプチド、b) 第1の末端で結合対の第2のメンバーとコンジュゲートしているポリヌクレオチドリンカー、ならびにc) ポリヌクレオチドリンカーの少なくとも一部と相補的なポリヌクレオチドとコンジュゲートしているエフェクター成分を含む、ポリペプチド-ポリヌクレオチド複合体である。