A mixed-mode chromatography method is provided for separating the correctly folded conformation of a given protein from the incorrectly folded conformation. This method accurately folds in commercially attractive yields, which makes it possible to produce etanercept preparations that have a very high purity with respect to correctly folded etanercept relative to incorrectly folded etanercept. Is very effective in separating etanercepts from incorrectly folded etanercepts and aggregates. The present invention further relates to protein preparations and formulations comprising correctly folded proteins obtained using this method, and therapeutic methods using high purity preparations obtained by mixed mode methods.所与のタンパク質の正確に折り畳まれた立体構造を不正確に折り畳まれた立体構造から分離するための混合モードクロマトグラフィー方法を提供する。本方法は、不正確に折り畳まれたエタネルセプトに対する正確に折り畳まれたエタネルセプトに関して非常に高純度を有するエタネルセプト調製物をもたらすことを可能にする、商業的に魅力的な収率での、正確に折り畳まれたエタネルセプトの、不正確に折り畳まれたエタネルセプトおよび凝集体からの分離に非常に有効である。本発明はさらに、本方法を使用して得られた正確に折り畳まれたタンパク質を含むタンパク質調製物および製剤、ならびに混合モード方法により得られた高純度調製物を使用する治療方法に関する。