本发明公开一种植物来源启动子、表达载体及应用,涉及基因工程技术领域;本发明公开的植物来源的高表达启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO:7所示;其是对拟南芥原启动子的碱基进行了更改,在保持原启动子功能的基础上,又能够避免被限制性内切酶切开的问题;本发明创建的表达载体适用于单子叶和双子叶植物,解决了现有载体所采用的Ubiqutin启动子序列太长、不易转化及双子叶植物表达丰度低的问题,也解决了CaMV35S启动子单子叶植物表达丰度偏低以及潜在的安全性问题;本发明创造性的在ccdB毒性蛋白的两端,分别加入多克隆位点,既能够满足限制性内切酶的需要,也能有效的抑制载体的假阳性。