A method for producing a flavonoid inclusion compound, comprising a desorption step of removing a rhamnose by treating a sparingly soluble flavonoid having a rhamnoside structure with an enzyme having rhamnosidase activity in the presence of cyclodextrin. According to the production method of the present invention, it is possible to efficiently produce a flavonoid inclusion compound or a flavonoid glycoside composition having excellent solubility in water, a pharmaceutical, a food and drink, a health food, a food for specified health use, and It can be suitably used in the field of cosmetics and the like.ラムノシド構造をもつ難溶性フラボノイドを、シクロデキストリンの存在下、ラムノシダーゼ活性を有する酵素で処理してラムノースを脱離する脱離工程を含む、フラボノイド包接化合物の製造方法。本発明の製造方法によれば、水への溶解性に優れるフラボノイド包接化合物やフラボノイド配糖体組成物を効率よく生産することができ、医薬品、飲食品、健康食品、特定保健用食品、及び化粧品などの分野において好適に利用することができる。