The present invention relates to a recombinant vector containing a cellulose-binding module 3 and a method for isolating a target protein using the recombinant vector. The protein isolation method of the present invention was transformed using the recombinant vector. Since it is possible to easily separate the fusion protein containing the target protein by binding the plant to cellulose, and to efficiently separate the target protein and the cellulose binding module by treating the fusion protein with enterokinase. It is expected to be applicable to various fields industrially. [Selection diagram] Fig. 3本発明は、セルロース結合モジュール3を含む組換えベクター及び前記組換えベクターを用いて目的タンパク質を分離する方法に関するもので、本発明のタンパク質分離方法は、前記組換えベクターを用いて形質転換された植物体をセルロースに結合させて目的タンパク質を含む融合タンパク質を容易に分離することが可能であり、融合タンパク質にエンテロキナーゼを処理して目的タンパク質とセルロース結合モジュールを効率的に分離することができるので、産業的に多様な分野に応用可能であると期待される。【選択図】図3