The present disclosure generally relates to the drilling control system and the drilling control method for surgical applications. The drilling control system may comprise a drilling device, a spatial sensor system and a control unit. The control unit may receive and store biomechanical information, mechanical information and spatial information to generate control output. With the present disclosure, the accuracy and safety of drilling process is greatly improved.一種鑽孔控制系統,包括一鑽孔設備及一用來控制該鑽孔設備的控制單元。鑽孔設備包括一手術工具、一可驅動該手術工具的鑽孔馬達、一偵測力學資訊的力學感測器、一用於接收一輸出控制信號且可偵測主軸資訊的機械臂組件及一安裝該機械臂組件的操作台。該控制單元連接一空間傳感系統。所述控制單元存儲有生物力學資訊,並根據從力學感測器產生的力學資訊、空間傳感系統產生的空間資訊及主軸資訊產生一鑽孔資訊。所述控制單元還根據生物力學資訊及鑽孔資訊計算得出偏差指標及根據所述偏差指標向鑽孔設備發送輸出控制信號。本發明還提供一種鑽孔控制方法。100‧‧‧鑽孔控制系統600‧‧‧控制單元200‧‧‧鑽孔設備400‧‧‧空間傳感系統210‧‧‧手術工具220‧‧‧力學感測器230‧‧‧機械臂組件240‧‧‧鑽孔馬達250‧‧‧驅動馬達