Disclosed are methods for producing purified Clostridial toxins, including tangential flow filtration, hydrophobic interaction chromatography and anion exchange chromatography. These methods are C.I. having a purity of about 90% or more. Provides good yield of C. difficile toxin. Also disclosed are highly purified Clostridial toxins, toxoids (eg, prepared by inactivating toxins as disclosed herein), and compositions comprising these toxins and / or toxoids. Is done. Also disclosed are methods of using purified toxins and / or toxoids to elicit an immune response against, for example, C. difficile (eg, C. difficile).接線流濾過、疎水性相互作用クロマトグラフィーおよび陰イオン交換クロマトグラフィーを含む、精製クロストリジウム菌毒素を製造する方法が開示される。これらの方法は、約90%以上の純度を有するC.ディフィシル(C.difficile)毒素の良好な収率をもたらす。高度に精製されたクロストリジウム菌毒素、(例えば、本明細書に開示されるように毒素を不活性化することにより調製された)トキソイド、ならびにこれらの毒素および/またはトキソイドを含む組成物もまた開示される。精製された毒素および/またはトキソイドを例えばクロストリジウム菌(例えば、C.ディフィシル(C.difficile))に対する免疫応答を誘発するために使用する方法もまた開示される。