本发明提供了一种β‑N‑乙酰葡糖胺酶NagGH3及其基因和NagGH3的制备方法。本发明提供的β‑N‑乙酰葡糖胺酶NagGH3具有SEQ ID NO.1所示的氨基酸序列。本发明提供了一种β‑N‑乙酰葡糖胺酶NagGH3的编码基因nagGH3。nagGH3具有SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。本发明提供了包含nagGH3的重组载体,该重组载体为重组质粒。本发明提供了包含重组载体的宿主细胞,重组载体转化宿主细胞得到重组菌株。本发明提供的β‑N‑乙酰葡糖胺酶NagGH3可促进壳二糖的水解,具有耐盐和耐产物抑制的性质,可应用于海产品加工、医学、功能性食品等行业。