A nutritional composition for use in restoring or promoting a healthy ecosystem and optimal microbial flora in humans or animals, comprising a protein source, a fat source and a source of carbohydrates and is supplemented with threonine, serine, proline and cysteine in an amount effective to promote growth and balance of bacterial microbiota amount providing the composition, serine in an amount from 0.07 to 0.35 gram / kilo of body weight / day proline in an amount from 0.07 to 0.3 grams / kilo of body weight / day, threonine in an amount from 0.04 to 0.20 grams / kilo body weight / day and cysteine in an amount of weight 0.03 0.15 grams / kilo of body weight / day.Una composición nutritiva para emplear en la restauración o promoción de un ecosistema sano y de una flora microbiana óptima en humanos o animales, la cual comprende una fuente de proteínas, una fuente de grasas y una fuente de hidratos de carbono y está suplementada con treonina, serina, prolina y cisteína en una cantidad eficaz para favorecer el crecimiento y el equilibrio de una flora microbiana bacteriana, proporcionando la composición, serina en una cantidad de 0,07 a 0,35 gramos/kilo de peso corporal/día prolina en una cantidad de 0,07 a 0,3 gramos/kilo de peso corporal/día, treonina en una cantidad de 0,04 a 0,20 gramos/kilo de peso corporal/día y cisteína en una cantidad de 0,03 a 0,15 gramos/kilo de peso corporal/día.