本发明公开了与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示;所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A,CC个体的生长速度显著高于AA个体;所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G,AA个体的生长速度显著高于GG个体;所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G,AA个体的生长速度显著高于GG个体。本发明所发现的3个SNP标记的应用,可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性,可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。