A method and system for automatically configuring a medical device that is at least partially implanted in a human recipient and that includes a transducer arranged to stimulate a physiological system of the recipient, such as a middle-ear implant for instance. The energy level of a signal provided to drive the transducer is progressively increased until there is a threshold electrical change indicative of a threshold change in impedance of the transducer. In the context of a middle-ear implant, for instance, the threshold electrical change indicative of the threshold change in impedance of the transducer may be indicative of the acoustic reflex. The energy level of the signal at that point is then used as a basis to set an operational parameter of the medical device, such as a comfort-level of the middle-ear implant for instance.L'invention concerne un procédé et un système de configuration automatique d'un dispositif médical qui est au moins partiellement implanté chez un receveur humain et qui comprend un transducteur prévu pour stimuler un système physiologique du receveur, tel qu'un implant de l'oreille moyenne par exemple. Le niveau d'énergie d'un signal fourni pour exciter le transducteur est progressivement augmenté jusqu'à ce que se produise un changement électrique seuil indiquant un changement seuil dans l'impédance du transducteur. Dans le contexte d'un implant de l'oreille moyenne, par exemple, le changement électrique seuil indiquant le changement seuil de l'impédance du transducteur peut indiquer le réflexe stapédien. Le niveau d'énergie du signal au niveau de ce point est ensuite utilisé en tant que base pour définir un paramètre de fonctionnement du dispositif médical, tel qu'un niveau de confort de l'implant de l'oreille moyenne, par exemple.