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遗传图谱构建方法和装置、单体型分析方法和装置
- 专利权人:
- 深圳华大基因科技服务有限公司
- 发明人:
- 宋卢挺,邵迪,郑泽群,郑智俊,吴逵,梁舒恒,陶晔,侯勇
- 申请号:
- CN201110246888.3
- 公开号:
- CN102952855B
- 申请日:
- 2011.08.26
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2015
- 代理人:
- 程泳
- 摘要:
- 本发明涉及基于单细胞全基因组测序的遗传图谱构建和单体型分析方法,以及用于所述方法的装置。遗传图谱构建方法包括将某物种单细胞的全基因组序列与参考序列进行比对,得到单核苷酸多态性位点基因型的统计结果;对基因型结果进行亲本分型,分为最合适的父本/母本(a/b)结果,使得所有细胞的统计结果中出现的重组次数最少;根据分型后的结果,将其划分为连锁区域(bin);通过计算a/b的变化比率得到所有相邻bin之间的重组率;根据每个重组位点的重组率,最终获得遗传图谱。本发明的方法能够利用单细胞获得高分辨率的遗传图谱,其不仅可用于人,还可用于一些繁殖能力有限的高等生物,特别是濒危物种。
- 来源网站:
- 中国工程科技知识中心
- 来源网址:
- http://www.ckcest.cn/home/