Without making complicate the configuration of the capsule medical device, there is provided a position detection system capable of determining the polarity of the sense coil. Position sensing system includes a plurality of sense coils 32 that outputs a detection signal by detecting an AC magnetic field generated from the marker coil and (i), the plurality of detection signals output from each of the sense coils 32 of the plurality of (i) Based on, and an arithmetic unit 46 for calculating the position of the capsule endoscope 10, the calculating unit 46 is calculated based on the plurality of detection signals, a plurality of sense coils 32 (i) detects the respective Based on the amplitude value of the AC magnetic field, among the plurality of sense coils 32 (i), a reference coil determiner 462 the amplitude value is determined as the reference coil up the sense coil, a first detection signal reference coil has output If, based on the second detection signal of the reference each of the sense coils 32 outside the coil (i) is outputted, and a polarity judging unit 463 judges the polarity of each of the sense coils 32 (i).カプセル型医療装置の構成を複雑にすることなく、センスコイルの極性を判定することができる位置検出システムを提供する。位置検出システムは、マーカコイルから発生した交流磁界を検出して検出信号を出力する複数のセンスコイル32(i)と、該複数のセンスコイル32(i)からそれぞれ出力された複数の検出信号に基づいて、カプセル型内視鏡10の位置を算出する演算部46とを備え、該演算部46は、複数の検出信号に基づいて算出された、複数のセンスコイル32(i)がそれぞれ検出した交流磁界の振幅値に基づいて、複数のセンスコイル32(i)のうち、振幅値が最大のセンスコイルを基準コイルとして決定する基準コイル決定部462と、基準コイルが出力した第1の検出信号と、該基準コイル以外の各センスコイル32(i)が出力した第2の検出信号とに基づいて、各センスコイル32(i)の極性を判定する極性判定部463とを有する。