一种批量计算LTR-反转座子插入时间的方法
- 专利权人:
- 江苏省农业科学院
- 发明人:
- 刘静,徐珍珍,杜建厂
- 申请号：
- CN201610128929.1
- 公开号：
- CN105808974A
- 申请日:
- 2016.03.07
- 申请国别(地区):
- 中国
- 年份:
- 2016
- 代理人:
- 徐蓓
- 摘要：
- 本发明公开了一种批量计算LTR‑反转座子插入时间的方法，具体步骤包括：将待测LTR‑反转座子的LTRs序列放到一个文本文件中，命名为INPUT，INPUT文件需为fasta格式，并且LTR‑反转座子两侧LTRs序列的ID以“|LTR1”或“|LTR2”结尾，运行事先编写的脚本即得到结果文件Insert_time，即为LTR‑反转座子的插入时间。本发明所述的LTR‑反转座子插入时间的计算方法速度快，效率高，实现了批量化、自动化和流程化计算。
- 来源网站：
- 中国工程科技知识中心
