A method for at least one of characterizing, diagnosing, and treating an autoimmune disorder in at least a subject, the method comprising: receiving an aggregate set of biological samples from a population of subjects； generating at least one of a microbiome composition dataset and a microbiome functional diversity dataset for the population of subjects； generating a characterization of the autoimmune condition based upon features extracted from at least one of the microbiome composition dataset and the microbiome functional diversity dataset； based upon the characterization, generating a therapy model configured to correct the autoimmune condition； and at an output device associated with the subject, promoting a therapy to the subject based upon the characterization and the therapy model.La présente invention concerne un procédé destiné à la caractérisation et/ou au diagnostic et/ou au traitement d'un trouble auto-immun chez au moins un sujet, le procédé consistant à : recevoir un ensemble cumulé d'échantillons biologiques provenant d'une population de sujets ； générer un ensemble de données concernant la composition du microbiome et/ou un ensemble de données concernant la diversité fonctionnelle du microbiome pour la population de sujets ； générer une caractérisation du dysfonctionnement auto-immun sur la base des caractéristiques extraites de l'ensemble de données concernant la composition du microbiome et/ou de l'ensemble de données concernant la diversité fonctionnelle du microbiome ； générer, sur la base de cette caractérisation, un modèle thérapeutique conçu pour corriger le dysfonctionnement auto-immun ； et établir pour le patient, sur un dispositif de sortie qui lui est associé, un traitement sur la base de la caractérisation et du modèle thérapeutique.
