A method for at least one of characterizing, diagnosing, and treating an endocrine system condition in at least a subject, the method comprising: receiving an aggregate set of biological samples from a population of subjects; generating at least one of a microbiome composition dataset and a microbiome functional diversity dataset for the population of subjects; generating a characterization of the endocrine system condition based upon features extracted from at least one of the microbiome composition dataset and the microbiome functional diversity dataset; based upon the characterization, generating a therapy model configured to correct the endocrine system condition; and at an output device associated with the subject, promoting a therapy to the subject based upon the characterization and the therapy model.L'invention concerne un procédé de caractérisation et/ou de diagnostic et/ou de traitement d'un dysfonctionnement du système endocrinien chez au moins un patient, le procédé comprenant les étapes consistant : à recevoir un ensemble agrégé d'échantillons biologiques provenant d'une population de patients ; à générer au moins un ensemble de données sur la composition du microbiome et/ou un ensemble de données sur la diversité fonctionnelle du microbiome pour la population de patients ; à caractériser le dysfonctionnement du système endocrinien sur la base de caractéristiques extraites de l'ensemble de données sur la composition du microbiome et/ou de l'ensemble de données sur la diversité fonctionnelle du microbiome ; générer, sur la base de cette caractérisation, un modèle thérapeutique conçu pour corriger le dysfonctionnement du système endocrinien ; et promouvoir auprès du sujet, sur un dispositif de sortie qui lui est associé, un traitement sur la base de la caractérisation et du modèle thérapeutique.