A method for at least one of characterizing, diagnosing, and treating a condition associated with microbiome taxonomic features in at least a subject, the method comprising: receiving an aggregate set of biological samples from a population of subjects； generating at least one of a microbiome composition dataset and a microbiome functional diversity dataset for the population of subjects； generating a characterization of the condition based upon features extracted from at least one of the microbiome composition dataset and the microbiome functional diversity dataset； based upon the characterization, generating a therapy model configured to correct the condition； and at an output device associated with the subject, promoting a therapy to the subject based upon the characterization and the therapy model.L'invention concerne un procédé pour caractériser, diagnostiquer et/ou traiter une affection associée à des éléments taxonomiques de microbiome chez au moins un sujet, le procédé comprenant : la réception un ensemble regroupé d'échantillons biologiques provenant d'une population de sujets ； la production d'au moins un ensemble de données concernant la composition du microbiome et d'un ensemble de données concernant la diversité fonctionnelle du microbiome pour la population de sujets ； la production d'une caractérisation de l'affection sur la base des éléments extraits d'au moins un ensemble parmi l'ensemble de données concernant la composition du microbiome et l'ensemble de données concernant la diversité fonctionnelle du microbiome ； sur la base de la caractérisation, la production d'un modèle thérapeutique conçu pour corriger l'affection ； et au niveau d'un dispositif de sortie associé au sujet, le fait de favoriser une traitement pour le sujet sur la base de la caractérisation et du modèle thérapeutique.
