Provided is a method and system for diagnosing and prognosing stroke, which is capable of accurately diagnosing stroke and reliably predicting the state of a stroke patient. A stroke diagnosis and prognosis prediction system includes: an image acquisition unit configured to receive a plurality of images including at least a part of a human brain; and an image registration unit that aligns the plurality of images based on a standard brain image. Part, a lesion area detection and mapping unit that detects each lesion area from a plurality of images, maps the detected lesion area to generate one mapping image, and scales the mapping image to a standard brain image. A matching and correcting unit that performs matching and performs image correction on the mapping image, a three-dimensional image generating unit that generates a three-dimensional lesion image by storing the mapping image in a three-dimensional data space, and a stroke based on the three-dimensional lesion image Diagnosing a stroke. [Selection diagram] Fig. 1脳卒中を正確に診断し、脳卒中患者の状態を確実に予測することができる脳卒中の診断及び予後予測方法とシステムを提供する。脳卒中の診断及び予後予測システムは、人間の脳の少なくとも一部を含む複数の画像を受信するように構成された画像取得部と、標準脳画像に基づいて複数の画像を位置合わせする画像位置合わせ部と、複数の画像からそれぞれの病変領域を検出し、検出された病変領域にマッピングして1つのマッピング画像を生成する病変領域検出及びマッピング部と、マッピング画像をスケーリングすることにより標準脳画像にマッチングさせ、マッピング画像に対する画像補正を行うマッチング及び補正部と、マッピング画像を3次元データ空間に格納することにより3次元病変画像を生成する3次元画像生成部と、3次元病変画像に基づいて脳卒中を診断する脳卒中診断部とを含む。【選択図】図1