The present disclosure provides guided microbial remodeling (GMR) methods for the rational improvement of plant-associated microbes to perform plant-beneficial functions. The GMR methods described herein allow for non-intergeneric genetic optimization of key regulatory networks within the microbes, which improve plant-beneficial functions over wild-type microbes but don't have the risks associated with transgenic approaches (e.g., unpredictable gene function, public and regulatory concerns, etc.). The present disclosure also provides remodeled microbes and compositions thereof. The utilization of remodeled microbes and compositions thereof will enable farmers to realize more productive and predictable crop yields without the nutrient degradation, leaching, or toxic runoff associated with traditional synthetically derived fertilizers.La présente invention concerne des procédés de remodelage microbien guidé (GMR) pour l'amélioration rationnelle de microbes associés à des plantes pour obtenir des fonctions bénéfiques pour les plantes. Les procédés GMR décrits dans la présente description permettent une optimisation génétique non intergénétique de réseaux régulateurs clés à l'intérieur des microbes, qui améliorent des fonctions bénéfiques pour les plantes par rapport à des microbes de type sauvage mais ne présentent pas les risques associés à des approches transgéniques (par exemple, une fonction génique imprévisible, des préoccupations publiques et réglementaires, etc.). La présente invention concerne également des microbes remodelés et des compositions associées. L'utilisation des microbes remodelés et des compositions associées permettra aux agriculteurs d'obtenir des rendements de récolte plus productifs et prévisibles sans la dégradation des nutriments, la lixiviation ni le ruissellement toxique associé aux engrais classiques obtenus par synthèse.
