本发明提供了一种口蹄疫合成肽疫苗,具体涉及用于口蹄疫合成肽疫苗的多肽,以及含有该多肽的疫苗及它们的制备方法,所述多肽具有SEQID NO.1、SEQ ID NO.2、SEQ ID NO.3、SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6所示的氨基酸序列。本发明通过对国内口蹄疫新近流行毒株的序列测定并结合口蹄疫疫苗毒株序列,研究其主要抗原位点的变异情况,同时结合计算机辅助进行抗原位点分析预测,对可能的抗原位点肽段进行化学合成。通过大量动物试验对这些候选多肽抗原进行筛选,根据筛选结果对口蹄疫病毒抗原位点进行了优化,并有效组合了T细胞表位和B细胞表位,增强了多肽抗原的免疫效果。该口蹄疫合成肽疫苗可以有效应对口蹄疫病毒的抗原变异,生物安全性好,易于大规模合成,具有良好的应用前景。