本发明公开了一个苦瓜籽核糖体失活蛋白及其编码基因与应用。其目的是提供一个苦瓜籽核糖体失活蛋白及其编码基因与其在制备抗肿瘤和/或病毒感染药物中的应用。该蛋白是下述氨基酸残基序列之一:1)序列表中的SEQ ID NO:1;2)将序列表中SEQ ID NO:1的氨基酸残基序列经过一至十个氨基酸残基的取代、缺失或添加具有抑制细胞内核糖体蛋白合成活性的蛋白质。该蛋白具有以下特点:1)抗肿瘤和病毒感染效果显着;2)安全性高;3)蛋白表达条件简单,易于纯化,生产成本低廉,因而适宜进行工业化生产,同时降低了制药成本,从而可减轻病人的经济负担。本发明为抗肿瘤和病毒感染提供了一条新途径,在医药学领域具有广阔的应用前景。