本发明提供了一种用于驱动基因在人红细胞系统中特异表达的启动子及应用,涉及基因工程技术领域。本发明所述启动子的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述启动子具有在红系中特异的干扰某基因的表达及研究红系特异性表达某基因的功能。通过基因重组技术构建不同长度的启动子驱动的EGFP表达的质粒,将质粒导入HEL及Ramos细胞后观察荧光表达情况,显示在HEL细胞中1001与1003活性无差异,但在Ramos细胞中1003活性显著高于1001,确定GYPA‑416bp(1001)具有红系特异性。本发明所述启动子对在红系系统疾病进行定向基因治疗及红系基因的研究具有重要的临床意义。