Labeled nucleotide analogs comprising at least one avidin protein, at least one dye-labeled compound, and at least one nucleotide compound are provided. The analogs are useful in various fluorescence-based analytical methods, including the analysis of highly multiplexed optical reactions in large numbers at high densities, such as single molecule real time nucleic acid sequencing reactions. The analogs are detectable with high sensitivity at desirable wavelengths. They contain structural components that modulate the interactions of the analogs with DNA polymerase, thus decreasing photodamage and improving the kinetic and other properties of the analogs in sequencing reactions. Also provided are nucleotide and dye-labeled compounds of the subject analogs, as well as intermediates useful in the preparation of the compounds and analogs. Compositions comprising the compounds, methods of synthesis of the intermediates, compounds, and analogs, and mutant DNA polymerases are also provided.L'invention concerne des analogues de nucléotides marqués comprenant au moins une protéine avidine, au moins un composé marqué par un colorant et au moins un composé nucléotidique. Ces réactifs sont utiles dans divers procédés analytiques basés sur la fluorescence, notamment l'analyse de réactions optiques hautement multiplexées en grand nombre à des densités élevées, telles que des réactions de séquençage en temps réel d'une seule molécule d'acide nucléique. Les analogues sont détectables avec une sensibilité élevée à des longueurs d'onde souhaitées. Ils contiennent des composants structuraux qui modulent les interactions des analogues avec l'ADN polymérase, en réduisant ainsi les dommages dus à la lumière et en améliorant la cinétique et d'autres propriétés des analogues dans les réactions de séquençage. L'invention concerne également des composés nucléotidiques et marqués par un colorant des analogues concernés, ainsi que des intermédiaires utiles dans la préparation des composés et de
