A modular, vertical bioreactor system includes a plurality of vertical bioreactor chambers each of which encloses an interior volume and has a height dimension which is greater than its width dimension. The system includes a drain manifold which is configured and operable to retain the bioreactor chambers in a spaced apart relationship and which defines a fluid channel which is in fluid communication with the interior volume of each of the vertical bioreactor chambers. The drain manifold may be a multipart manifold. The system includes a fluid delivery assembly which is capable of being connected to a source of fluid and which operates to deliver a fluid from that source to the interior volume of each of the plurality of bioreactors. The system may be modular and may be reconfigured so as to accommodate varying applications. The system may be integrated with an aquaculture system and operated so as to remove nitrogenous waste from the aquaculture system. Also disclosed are methods for using the system.Un système de bioréacteur modulaire vertical comprend une pluralité de chambres de bioréacteur verticales, chacune englobant un volume intérieur et ayant une dimension en hauteur plus grande que sa dimension en largeur. Le système comprend un manifold de vidange qui est conçu et fonctionne pour maintenir séparées les chambres du bioréacteur et qui définit un canal de fluide qui est en communication fluidique avec le volume intérieur de chacune des chambres verticales du bioréacteur. Le manifold de vidange peut être un manifold en plusieurs parties. Le système comprend un ensemble dapprovisionnement en fluide qui est capable dêtre connecté à une source de fluide et qui fonctionne pour fournir un fluide de cette source au volume intérieur de chaque bioréacteur de la pluralité. Le système peut être modulaire et peut être reconfiguré de façon à pouvoir sadapter à différentes applications. Le système peut être intégré à un système daquaculture et utilisé de façon à éliminer