本发明公开了一种来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列,该序列具有如SEQ ID NO.1所述的核苷酸序列。该序列是一种新的TPS基因序列,使人们对TPS基因的研究对象从大肠杆菌和真菌等微生物及少数有限的植物体进一步扩展到垫状卷柏等多种植物体。并且,根据该TPS基因在垫状卷柏植物体内催化合成的海藻糖所表现出的优良的抗旱、耐盐等性能可以预料:如果将其通过转基因技术导入玉米等其他植物的基因中,将可培育出具有相应的优良的抗旱、耐盐等性能的植物新品种。本发明还公开了一种上述来源于垫状卷柏的海藻糖-6-磷酸合成酶基因序列的克隆方法。