A method of preparing an animal feed supplement or pet food, based on mucosal tissue from bovine or porcine, wherein the method comprises the following steps: i) processing enzymatically or hydrolyze mucosal tissue, ii) recovering hydrolysed proteins or parts thereof having a molecular weight less than or equal kDa iii) desalting said protein hydrolyzate of porcine or bovine mucosa obtained after step ii) by electro-dialysis.Un procedimiento de preparación de un suplemento de alimentación animal o de alimentos para mascotas, en base de tejido de mucosa procedente de bovino o porcino, caracterizado porque el procedimiento comprende las etapas siguientes: i) procesar enzimáticamente o hidrolizar tejido de mucosa, ii) recuperar las proteínas hidrolizadas o partes de las mismas que tienen un peso molecular igual o menor que kDa iii) desalar dicho hidrolizado proteico de la mucosa porcina o bovina obtenida después de la etapa ii) mediante electro-diálisis.