The present invention describes methods of predicting high or low likelihood of developing inflammatory bowel disease (IBD) in a subject, and methods of diagnosing inflammatory bowel disease (IBD) in a subject. The invention further provides methods of identifying genes / locus associated with disease states such as IBD, CD, and / or UC. [Selected figure] Figure 8C.本発明は、被験体における炎症性腸疾患(IBD)を進行させる可能性が高い又は低いことを予測する方法、及び、被験体の炎症性腸疾患(IBD)を診断する方法を記載する。本発明は、IBD、CD、及び/又はUCなどの疾患状態に関連付けられる遺伝子/遺伝子座を同定する方法を更に提供する。【選択図】図8C