This biopsy system comprises an endoscope having an insertion portion having a channel and an active bending portion disposed at a part of the insertion portion, and a treatment instrument. The treatment instrument has a sheath insertable in the channel and a needle tube disposed inside the sheath. The sheath has a distal barrel including the distal end of the sheath and a proximal barrel fixed to the proximal end of the distal barrel and less flexible than the distal barrel. The connection part which becomes the boundary part between the distal barrel part and the proximal barrel part is formed in such a manner that the distal end of the sheath protrudes from the distal end of the channel and is optically observable by the endoscope, And is located closer to the proximal side than the proximal end.この生検システムは、チャンネルを有する挿入部と挿入部の一部に配された能動湾曲部とを備えた内視鏡と、処置具とを備える。処置具は、チャンネル内に挿通可能なシースと、シースの内部に配された針管とを有する。シースは、シースの遠位端を含む遠位筒部と、遠位筒部の近位端に固定され遠位筒部よりも可撓性が低い近位筒部とを有する。遠位筒部と近位筒部との境界部位となる接続部は、シースの遠位端がチャンネルの遠位端から突出して内視鏡により光学的に観察可能である位置関係において湾曲部の近位端よりも近位側に位置している。