本发明涉及植物基因工程领域,提供了一种荞麦Na+/H+逆向转运蛋白FtNHX,为具有序列表中的SEQ ID No:2氨基酸残基序列的蛋白质,或序列表中的SEQ ID No:2经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与SEQ ID No:2氨基酸残基序列相同活性的由SEQ ID No:2衍生的蛋白质。编码此蛋白的基因优选为包括SEQ ID No:1第288~1949位的核苷酸序列;或者是与SEQ ID No:1限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的核苷酸序列。本发明还提供了重组载体的构建、转基因植物等方法以应用上述基因和蛋白质,可培育耐盐性更强或其他生物学性状得到改善的转基因植物新品种。