本发明公开了一种盐角草Na+/H+逆向转运蛋白及其编码基因与应用。本发明所提供的盐角草Na+/H+逆向转运蛋白来源于盐角草(Salicornia europaea L.),名称为SeNHX1,是具有序列表中序列2氨基酸残基序列的蛋白质,或者是将序列2的氨基酸残基序列经过一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加且具有与序列2的氨基酸残基序列相同活性的由序列2衍生的蛋白质。盐角草Na+/H+逆向转运蛋白的编码基因SeNHX1,是下列核苷酸序列之一:1)序列表中的SEQ ID №:1;2)编码序列表中SEQ ID №:2蛋白质序列的多核苷酸;3)与序列表中SEQ ID №:1限定的DNA序列具有90%以上同源性,且编码相同功能蛋白质的DNA序列。本发明的基因对培育抗盐植物品种,提高农作物产量具有重要意义。