Method of treating ballast water which is characterized in that a mixture of hypochlorite and ammonia or ammonium salts in the ballast water, and to suppress the generation of trihalomethanes and to kill, sterilize the aquatic organisms in the ballast water, and the treatments of ballast water used in the process.バラスト水にアンモニア又はアンモニウム塩と次亜塩素酸塩とを混合し、バラスト水中の水生生物を殺滅・殺菌させ且つトリハロメタン類の発生を抑制することを特徴とするバラスト水の処理方法、及び当該方法に用いるバラスト水の処理剤。