It is an object of the present invention to provide a freeze-dried preparation having improved storage stability of a hepatocyte growth factor as compared with conventional freeze-dried preparations. The present invention relates to a pharmaceutical composition comprising (1) hepatocyte growth factor, (2) trehalose and (3) arginine, histidine, lysine, meglumine, glutamic acid, aspartic acid, proline, creatine, creatinine, tris (hydroxymethyl) Or a pharmaceutically acceptable salt thereof. The present invention also provides a freeze-dried preparation comprising at least one compound selected from the group consisting of pharmaceutically acceptable salts thereof.본 발명의 목적은 종래의 동결건조 제제에 비하여, 간세포 생장 인자의 저장 안정성이 개선된 동결건조 제제를 제공하는 것이다. 본 발명은, (1) 간세포 생장 인자, (2) 트레할로스 및 (3) 아르기닌, 히스티딘, 리신, 메글루민, 글루탐산, 아스파르트산, 프롤린, 크레아틴, 크레아티닌, 트리스(하이드록시메틸)아미노메탄 및 이들의 약학적으로 허용 가능한 염으로 구성되는 군으로부터 선택되는 1 종 이상의 화합물을 포함하는 동결건조 제제를 제공한다.