A process and a system using a disinfecting atmosphere for deactivating Bacillus bacteria and its spores, such as Bacillus anthracis (anthrax) and C Botulinum and its spores, commonly proposed as bioterrorism threats, are described. Said disinfecting atmosphere includes ozone at a concentration of 2-350 ppm by weight and hydrogen peroxide at an amount of 0.2 -10 weight percent at a relative humidity of at least 60%.Linvention porte sur un processus et sur un système utilisant une atmosphère stérilisante pour désactiver les bactéries Bacillus et leurs spores, telles que le Bacillus anthracis (anthrax) et le C Botulinum et leurs spores, proposés communément comme menaces de terrorisme biologique. Ladite atmosphère stérilisante comprend de lozone à une concentration de 2 à 350 parties par million (ppm) en poids et du peroxyde dhydrogène à une quantité de 0,2 à 10 % en poids à une humidité relative dau moins 60 %.