An endoscope system according to the present invention includes: an imaging unit that generates two image data in which at least a part of an acquisition area of a subject image is different, or two pieces of image data having parallax with respect to a common subject A first processor that performs image processing on image data, a second processor that performs image processing on the other image data, and a casing that is a separate body from the casing provided with the first processor and the second processor A display image generation unit provided in the first processor and configured to generate display image data based on two image data output from the first processor and / or the second processor, And a first synchronization signal generation unit that generates a synchronization signal for synchronizing the imaging unit, the first processor, the second processor, and the display image generation unit.本発明にかかる内視鏡システムは、被写体像の取得エリアの少なくとも一部が互いに異なる二つの画像データ、または共通の被写体に対して視差を有する二つの画像データを生成する撮像部と、一方の画像データに対して画像処理を施す第1プロセッサと、他方の画像データに対して画像処理を施す第2プロセッサと、第1プロセッサおよび第2プロセッサが設けられている筐体とは別体の筐体に設けられ、第1プロセッサおよび/または第2プロセッサから出力された二つの画像データをもとに、表示画像データを生成する表示画像生成部と、第1プロセッサまたは第2プロセッサに設けられ、撮像部、第1プロセッサ、第2プロセッサおよび表示画像生成部の同期をとるための同期信号を生成する第1の同期信号生成部と、を備える。