PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a medical image processing apparatus and an endoscope apparatus which, even if a fluorescent state caused by a fluorescent reagent continues only for limited time, enables determination of a distributed state of cancer to thereby make it possible to plan the priority order of sites of the cancer to be removed.SOLUTION: A medical image processing apparatus according to an embodiment comprises: a first input unit for inputting endoscopic images of a biological tissue which are captured in a plurality of time phases and in which fluorescent regions of the biological tissue are made to fluoresce for a predetermined period of time by administration of an agent a second input unit for inputting volume data corresponding to the biological tissue and a synthesis unit for performing alignment between the endoscopic images and the volume data to cumulatively map the fluorescent region in each of the plurality of time phases to the volume data.SELECTED DRAWING: Figure 2COPYRIGHT: (C)2018,JPO&INPIT【課題】蛍光試薬による蛍光状態が限られた時間であっても、癌の分布状態を把握し、切除する癌の部位の優先順位を策定することができる医用画像処理装置および内視鏡装置を提供する。【解決手段】実施形態に係る医用画像処理装置は、複数時相について撮影された、薬剤の投与によって生体組織の蛍光領域を所定期間蛍光させた、生体組織の内視鏡画像を入力する第1入力部と、前記生体組織に対応するボリュームデータを入力する第2入力部と、前記内視鏡画像と前記ボリュームデータとの位置合わせを行って、前記複数時相それぞれにおける前記蛍光領域を、前記ボリュームデータに累積的にマッピングする合成部と、を備える。【選択図】 図2