As a means for solving the problem of providing a nucleic acid complex that is not degraded at the DNA-RNA junction even in vivo, the 3'-position of the deoxyribonucleotide residue at the 3'-end of the single-stranded DNA and two A nucleic acid complex in which the 5′-position of the ribonucleotide residue at the 5′-end of one ribonucleotide strand of the strand RNA is bound, and 2 in the 5′-end nucleotide of the ribonucleotide strand bound to the single-stranded DNA Between the 3 ′ position of the first ribonucleotide bound to the single-stranded DNA and the 5 ′ position of the adjacent ribonucleotide, wherein the hydroxyl group at the position is substituted with an alkoxy group or a halogen group and / or Nucleic acids in which the phosphate diester group is replaced with any of phosphorothioate group, dithiophosphate diester group and trithiophosphate diester group To provide a united.生体内においても、ＤＮＡとＲＮＡの連結部で分解されない核酸複合体を提供するという課題を解決する手段として、一本鎖ＤＮＡの３’側末端のデオキシリボヌクレオチド残基の３’位と、二本鎖ＲＮＡの一方のリボヌクレオチド鎖の５’側末端のリボヌクレオチド残基の５’位が結合した核酸複合体であって、一本鎖ＤＮＡと結合したリボヌクレオチド鎖の５’側末端ヌクレオチドにおける２’位のヒドロキシル基がアルコキシ基またはハロゲン基で置換されており、かつ／または一本鎖ＤＮＡと結合した最初のリボヌクレオチドの３’位と、それに隣接するリボヌクレオチドの５’位との間のリン酸ジエステル基がホスホロチオエート基、ジチオリン酸ジエステル基およびトリチオリン酸ジエステル基のいずれかで置換されている核酸複合体を提供する。
