本发明属于酶学和药物化学领域,涉及一种低分子透明质酸盐、其制备方法及用途。具体地,所述制备方法包括使用由保藏号为CGMCC No.5744的芽孢杆菌制得的透明质酸酶或者SEQ ID NO:2所编码的透明质酸酶对分子量大于1000kDa的透明质酸或其盐进行降解的步骤。本发明利用芽孢杆菌生产的透明质酸酶制备低分子透明质酸或其盐的方法操作简单,条件温和,对产品结构无破坏,无环境污染,而且发酵来源的透明质酸酶成本低,适合大规模工业化生产。本发明制备的低分子透明质酸盐具有透皮吸收性好、纯度高、无细胞毒性、抗氧化能力强、颜色无褐变等优点,可用在化妆品、食品及医药领域。