PROBLEM TO BE SOLVED: To analyze the movement of an eyeball of a subject with high accuracy even when the distance between the imaging unit and the subject changes without using a Purkinje image and without performing calibration in advance. Provided are an eye movement analysis system, an eye movement analysis method, and a program capable of performing eye movement analysis. An eye movement analysis system includes an imaging unit that captures a moving image including at least one of a subject's right eye and left eye and a comparison target on the surface of the subject's face, and the imaging. At least one of the right eye and the left eye of the subject based on the relationship between at least one of the right eye and the left eye of the subject and the comparison target on the moving image taken by the unit. It is equipped with an analysis unit that analyzes the movement of one eyeball. [Selection diagram] Fig. 1【課題】プルキンエ像を使用する必要なく、事前にキャリブレーションを行う必要なく、撮影部と被検者との距離が変化した場合であっても被検者の眼球の運動を高精度に解析することができる眼球運動解析システム、眼球運動解析方法およびプログラムを提供する。【解決手段】眼球運動解析システムは、被検者の右眼および左眼の少なくとも一方と、前記被検者の顔の表面上の比較対象とを含む動画像を撮影する撮影部と、前記撮影部によって撮影された前記動画像上における前記被検者の前記右眼および前記左眼の少なくとも一方と前記比較対象との関係に基づいて、前記被検者の前記右眼および前記左眼の少なくとも一方の眼球の運動を解析する解析部とを備える。【選択図】図1