According to the present invention, a first step of obtaining an acidic xyloligosaccharide from a plant-derived raw material, and a second step of obtaining a polypentosan sulfate from the acidic xyloligosaccharide, the first step is a depolymerization step of the plant-derived raw material It includes, the second step of the acid xylo-oligosaccharides, and the sulfation step of the polysulfuric acid, including a deacetylation step of adding a base to a pH of 11 or more as a post process than the depolymerization step of A manufacturing method is provided. By the production method of the present invention, it is possible to obtain a low acetyl group content of polysulfuric acid pentosan. In addition, by the production method of the present invention, polypentosan sulfate can be obtained at low cost efficiently and with high yield.본 발명에 의해, 식물 유래 원료로부터 산성 자일로올리고당을 얻는 제1 공정과, 상기 산성 자일로올리고당으로부터 폴리황산펜토산을 얻는 제2 공정을 포함하며, 제1 공정은 상기 식물 유래 원료의 해중합 공정을 포함하고, 제2 공정은 상기 산성 자일로올리고당의 황산화 공정을 포함하며, 상기 해중합 공정보다 후 공정으로서 pH 11 이상으로 하기 위해 염기를 첨가하는 탈아세틸화 공정을 포함하는 폴리황산펜토산의 제조 방법이 제공된다. 본 발명의 제조 방법에 의해, 저아세틸기 함량의 폴리황산펜토산을 얻을 수 있다. 또한, 본 발명의 제조 방법에 의해, 폴리황산펜토산을 저가로 효율적이고 고수율로 얻을 수 있다.