Disclosed are a system for diagnosing a predetermined disease (for example, prostate cancer) and visualizing a tissue part diagnosed as a disease to be accurately recognized when an image of a living tissue is inputted using a neural network learned by performing learning through a neural network and a method thereof. According to an embodiment of the present invention, a system for diagnosing a disease is implemented in a system including a processor and a storage device for storing a neural network and uses a slide which is a biometric image and the neural network. The system for diagnosing a disease comprises: a patch neural network for generating a patch level diagnosis result of whether a disease exists in each predetermined patch of which a slide is divided into a predetermined size; a heat map generation module for generating a patch level heat map image corresponding to the slide based on each patch diagnosis result of each of a plurality of patches included in the slide; a tissue mask generation module for generating a tissue mask image corresponding to the slide based on a hue-saturation-value (HSV) model corresponding to the slide; and a visualization module for generating a disease diagnosis visualization image corresponding to the slide based on the patch level heat map image and the tissue mask image.뉴럴 네트워크를 통한 학습을 수행하여 학습된 뉴럴 네트워크를 이용하여 생체조직의 이미지를 입력할 경우 소정의 질병(예컨대, 전립선 암)을 진단할 수 있으며 질병으로 진단된 조직(티슈) 부위를 정확히 파악할 수 있도록 시각화하는 시스템 및 그 방법이 개시된다. 본 발명의 일 측면에 따르면, 프로세서 및 뉴럴 네트워크를 저장하는 저장장치를 포함하는 시스템에 구현되며 생체이미지인 슬라이드와 상기 뉴럴 네트워크를 이용한 질병의 진단 시스템에 있어서, 상기 진단 시스템은, 상기 슬라이드가 소정의 크기로 분할된 소정의 패치 각각에 질병이 존재하는지 여부인 패치 레벨 진단결과를 생성하는 패치 뉴럴 네트워크, 상기 슬라이드에 포함된 다수의 패치들 각각의 패치 진단결과에 기초하여 상기 슬라이드에 상응하는 패치 레벨 히트맵 이미지를 생성하는 히트맵 생성모듈, 상기 슬라이드에 상응하는 HSV(Hue-Saturation-Value) 모델에 기초하여 상기 슬라이드에 상응하는 티슈 마스크 이미지를 생성하는 티슈 마스크 생성모듈 및 상기 패치 레벨 히트맵 이미지와 상기 티슈 마스크 이미지에 기초하여 상기 슬라이드에 상응하는 질병 진단 시각화 이미지를 생성하는 시각화 모듈을 포함하는 진단 시스템이 제공된다.