The invention provides methods of formulating an anti-inflammatory composition for treating inflammatory conditions in a specific organ or tissue. The method involves selecting at least one pathogen that is pathogenic in the specific organ or tissue; producing an antigenic composition comprising antigenic determinants that together are specific for the pathogen; and formulating the antigenic composition for administration as an anti-inflammatory composition capable of eliciting an anti-inflammatory response in the specific organ or tissue, wherein the condition characterized by inflammation is not a cancer. In embodiments of the invention, a cancer is situated in the specific organ or tissue.La presente invención se refiere a una composición antigénica para usarse en tratar un paciente humano que tiene enfermedad de Crohn, en donde la composición antigénica comprende células de Escherichia coli patogénicas completas muertas o atenuadas, y en donde la composición antigénica está adaptada para ser administrable por vía intradérmica o subcutánea en un sitio de administración en dosis sucesivas con in intervalo de dosificación de entre una hora y un mes, durante una duración de dosificación de al menos 1 semana, 2 semanas, 2 meses o 6 meses .