A method for operating an endothelium reflection microscope apparatus, the apparatus comprising an optical head (1) comprising: an illuminating system (16, 17, 18, 36), an eye-front observation optical system (12, 29, 2) along a central channel (15) in which an alignment-use light spot is received and imaged by a camera (2) comprising a digital optical sensor, and an enlargedimaging optical system (24, 25, 26, 27) for enlarged observation or photographing of the subject part by said digital camera (2), the apparatus further comprising drive means (6) for moving the optical head (1) and CPU control means (3) for automatically controlling said drive means (6), said illuminating system and said eyefront optical system, the method being characterized by an endothelium image acquisition procedure in which the grey level inside a check area (34) of said camera sensor is constantly checked during the advancement along an advancement direction (Z-) when said grey level reaches a predetermined threshold value, a delay time (it) is triggered and when said delay time (at) lapses, the acquisition of one or more images of the endothelium by the digital camera (2) is enabled.Linvention concerne un procédé pour faire fonctionner un appareil à microscope à réflexion dendothélium, lappareil comprenant une tête optique (1) qui contient: un système déclairage (16, 17, 18, 36), un système optique dobservation frontal (12, 29, 2) ménagé le long dun canal central (15) dans lequel un point lumineux utilisé pour lalignement est reçu et pris en image par une caméra (2), qui comprend un capteur optique numérique, et un système optique à imagerie élargie (24, 25, 26, 27) destiné à lobservation élargie ou à la prise en photo de la partie du sujet par ladite caméra numérique (2), lappareil comprenant un moyen dentraînement (6) pour déplacer la tête optique (1) et le moyen de commande à UC (3) destiné à commander automatiquement ledit moyen dentraînement (6), ledit système déclairage et ledit
