A method for detecting a modified nucleotide base in a DNA sample by excising the target's modified base using a specific DNA glycosylase has been described. The DNA molecule is then labeled using a DNA polymerase that lacks 3 'to 5' exonuclease activity and strand displacement activity. This method can be used to detect epigenetic changes and DNA damage. Based on the detection of modified bases, to diagnose a disease or condition, determine the risk of a disease or condition, identify the appropriate treatment, monitor the effectiveness of a treatment, and side effects of treatment in a subject A method for monitoring is provided. A method for determining environmental exposure or environmental exposure time of a biological sample containing DNA is also provided. Kits, systems and devices for performing the described methods are also provided.特異的DNAグリコシラーゼを使用して標的の修飾された塩基を切除して、DNA試料における修飾されたヌクレオチド塩基を検出する方法が記載されている。次に、DNA分子は、3’→5’エキソヌクレアーゼ活性および鎖置換活性を欠くDNAポリメラーゼを使用して標識される。本方法を使用して、エピジェネティック変化およびDNA損傷を検出することができる。修飾された塩基の検出に基づき、疾患または状態を診断するため、疾患または状態のリスクを決定するため、適切な処置を識別するため、処置の有効性をモニタリングするため、および対象における処置の副作用をモニタリングするための方法が提供される。DNAを含有する生物学的試料の環境曝露または環境曝露時間を決定するための方法も提供される。記載されている方法を行うためのキット、システムおよびデバイスも提供される。